About: Complex structural analysis of interaction at the protein - nucleic acid interface by unique bioinformatic descriptors

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Complex structural analysis of interaction at the protein - nucleic acid interface by unique bioinformatic descriptors Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Navrhujeme provést komplexní analýzu rozhraní mezi proteiny a nukleovými kyselinami (NA) pomocí unikátních nástrojů strukturní bioinformatiky vyvinutých na pracovištích navrhovatelů. Věříme, že jedinečnost tohoto návrhu spočívá v komplementaritě obou týmů: Zatímco Dr. de Brevern vyvinul nástroje pro klasifikaci lokální proteinové konformace, Dr. Schneider vyvinul metodologii klasifikace konformací NA. Rozhraní mezi proteiny a NA je vědecky důležité, protože interakce mezi těmito makromolekulami je klíčový krok základních biologických procesů jako transkripce, replikace, translace, či sestřihávání a chyby při rozpoznávání vedou k poškození i smrti zasažených buněk. Mnoho zásadních aspektů interakce není přitom popsáno, k jejich pochopení významně přispěje navrhovaný detailní popis rozhraní v termínech lokální struktury proteinů a NA. Popis rozhraní pomocí omezeného počtu konformerů (16 pentapeptidových konformerů a asi 20 DNA a 40 RNA konformerů) umožní redukci složité informace o interakcích v pros (cs) We propose a complex analysis of the protein-nucleic acid (NA) interface by use of unique tools of structural bioinformatics developed in the collaborating labs. We believe that importance of the proposal is in the complementarity between both teams: While Dr. De Brevern developed tools for classification of local protein conformation, Dr. Schneider developed protocol for classification of NA. The protein-NA interface is important because interaction between these macromolecules is crucial in the fundamental biological processes as transcription, replication, or splicing. Errors in the recognition process may lead to damage or death of the inflicted cell. Many fundamental aspects of the recognition has not been described, the proposed project will significantly contribute to its understanding by labeling the interacting molecules by their local conformations. Reduction of conformations of protein and NA residues to a limited number of conformers simplifies complicated 3-dimensional information ab (en)
Title	Komplexní strukturní analýza interakcí na rozhraní protein - nukleová kyselina unikátními bioinformatickými deskriptory. (cs) Complex structural analysis of interaction at the protein - nucleic acid interface by unique bioinformatic descriptors (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/10999/2010-32
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/M2
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54022432
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/BO
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/ME
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	bioinformatics; protein; DNA; RNA; nucleic acid; structure; molecular recognition (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/MSM
http://linked.open...avai/start-reseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	107 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	107 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	0 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/MEB021032/ico-86652036 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2011/MEB021032/ico-86652036 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/MEB021032/ico-86652036

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software