The interactions of nucleic acid bases, nucleotides, polynucleotides and polypeptides adsorbed at the surfaces of mercury and some metal monocrystals will be studied by the electrochemical impedance spectroscopy, ellipsometry and STM/AFM microscopy. The interactions berween adsorbed bases can result in their two-dimensional (2-D) condensation. The course of 2-D condensation of nucleic acid bases at the mercury and gold surface will be compared and the effect of ribose and deoxyribose will be determined.The experimental results will be compared with the quantum chemical calculations. The aim of the proposed project is to obtain information on the effect of the electric field of the metal-solution interface on the structure of biopolymers and on the interactions of theirs monomeric components. The results can contribute to clear up the molecular mechanism of the interactions of biopolymers with charged membrane surfaces and with chemotherapeutics. (en)
Interakce bazí nukleových kyselin, nukleosidů, polynukleotidů a polypeptidů adsorbovaných na povrchu rtuti a monokrystalů některých kovů budou studovány elektrochemickou impedanční spektroskopií, elipsometrií a metodami mikroskopie STM a AFM. Interakce mezi adsorbovanými bazemi mohou vést k jejich dvojrozměrné (2-D) kondenzaci. Bude porovnán průběh 2-D kondenzace bazí nukleových kyselin na povrchu rtuti a na povrchu zlata a bude stanoven vliv ribosy a deoxyribosy na tento průběh. Experimentální výsledky budou porovnány s kvantově chemickými výpočty. Cílem navrhovaného projektu je získat informace o působení elektrického pole fázového rozhraní mezi roztokem a kovovou elektrodou na strukturu biopolymerů a na interakce jejich monomerních složek. Výsledky přispějí k objasnění molekulárního mechanismu interakce biopolymerů s elektricky nabitými povrchy membrán a s chemoterapeutiky.
Mezimolekulární interakce nukleosidů vedou k jejich 2D kondenzaci na povrchu elektrod. Kinetika kondenzace závisí na pH prostředí a elektrickém poli elektrody. Smíšené kvadruplexy tetranukleotidů vyžadují pro svoji stabilizaci monovalentní ionty. (cs)