About: DNA labeling with redox markers for electrochemical sensing. Applications in analysis of nucleotide sequences and molecular diagnostics

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: DNA labeling with redox markers for electrochemical sensing. Applications in analysis of nucleotide sequences and molecular diagnostics Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA400040901
Description	The aim of this project is the development of novel techniques of DNA labeling and their utilization in DNA electrochemical analysis and biosensor design. The DNA labeling will involve (1) synthesis of nucleoside triphosphate conjugates (modified at nucleobase) with redox-active moieties using aqueous cross-coupling reactions, and (2) their incorporation to DNA by enzymes. Methodology of construction of DNA probes bearing redox markers at specific positions will be developed. Electrochemical features of the modified nucleotides and nucleic acids, as well as the influence of DNA structure on electrochemical responses of the conjugate markers, will be studied. Based on these investigations, we will choose labels and analytical procedures suitable for efficient analysis of nucleotide sequences, with emphasis on applications in molecular diagnostics of severe diseases. The labeled nucleic acids will be used in development of novel electrochemical biosensors. (en) Projekt je zaměřen na vývoj nových technik značení DNA a jejich využití v elektrochemické analýze DNA a při konstrukci biosenzorů. Značení DNA bude založeno na (1) syntéze konjugátů nukleosid trifosfátů (modifikovaných na nukleobázi) s redox-aktivními skupinami pomocí cross-coupling reakcí ve vodném prostředí a (2) jejich inkorporaci do DNA pomocí enzymů. Bude vypracována metodika konstrukce DNA sond značených ve specifických pozicích. Budou zkoumány elektrochemické vlastnosti modifikovaných nukleotidů a nukleových kyselin a vliv struktury DNA na elektrochemické odpovědi konjugovaných značek. Na základě tohoto výzkumu budou vybrány značky a analytické postupy vhodné pro efektivní analýzu nukleotidových sekvencí, se zaměřením na aplikace v molekulární diagnostice závažných onemocnění. Značené nukleové kyseliny budou využity při vývoji nových biosenzorů.
Title	DNA labeling with redox markers for electrochemical sensing. Applications in analysis of nucleotide sequences and molecular diagnostics (en) Značení DNA redoxními markery pro elektrochemickou detekci. Aplikace v analýze nukleotidových sekvencí a v molekulární diagnostice.
skos:notation	IAA400040901
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040901/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040901/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-04-14 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100737842
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CG - Elektrochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	electrochemistry; DNA; electroactive markers; modified bases; DNA polymerase; hybridization; mutation; gene expression; biosensor (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	2 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-02-27 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA400040901
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02009-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CC - Organická chemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Methodology for DNA redox labeling was developed based on synthesis of modified dNTP and their enzymatic incorporation. Electroanalysis of labeled DNA was optimized and new methods proposed for analysis of DNA sequences and interactions with proteins. (en) Byla vypracována metodika redoxního značení DNA založená na syntéze modifikovaných dNTP a jejich enzymatické inkorporaci. Byla optimalizována elektrochemická analýza značené DNA a navrženy nové metody pro analýzu DNA sekvencí a interakcí s proteiny. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	electrochemistry DNA DNA polymerase electroactive markers gene expression hybridization modified bases mutation
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Enzyme-linked electrochemical DNA ligation assay using magnetic beads Electrochemical detection of DNA binding by tumor suppressor p53 protein using osmium-labeled oligonucleotide probes and catalytic hydrogen evolution at the mercury electrode Benzofurazane as a New Redox Label for Electrochemical Detection of DNA: Towards Multipotential Redox Coding of DNA Bases Aqueous Heck Cross-Coupling Preparation of Acrylate-Modified Nucleotides and Nucleoside Triphosphates for Polymerase Synthesis of Acrylate-Labeled DNA Base-modified DNA labeled by [Ru(bpy)3]2+ and [Os(bpy)3]2+ complexes: construction by polymerase incorporation of modified nucleoside triphosphates, electrochemical and luminescent properties, and applications Tetrathiafulvalene-labelled nucleosides and nucleoside triphosphates. Synthesis, electrochemistry and scope of their polymerase incorporation into DNA Detection of single nucleotide polymorphisms in p53 mutation hotspots and expression of mutant p53 in human cell lines using an enzyme-linked electrochemical assay Anthraquinone as a Redox Label for DNA: Synthesis, Enzymatic Incorporation, and Electrochemistry of Anthraquinone-Modified Nucleosides, Nucleotides, and DNA Osmium tetroxide complexes as versatile tools for structure probing and electrochemical analysis of biopolymers Monitoring of in vitro DNA synthesis and PCR amplification using 7-deaza-purines as electroactive markers Tail-labelling of DNA probes using modified deoxynucleotide triphosphates and terminal deoxynucleotidyl tranferase. Application in electrochemical DNA hybridization and protein-DNA binding assays Alkylsulfanylphenyl derivatives of cytosine and 7-deazaadenine nucleosides, nucleotides and nucleoside triphosphates. Synthesis, polymerase incorporation to DNA and electrochemical study Direct voltammetric analysis of DNA modified with enzymatically incorporated 7-deazapurines Nucleobase modification as redox DNA labelling for electrochemical detection Redox labels and indicators based on transition metals and organic electroactive moieties for electrochemical nucleic acids sensing Synthesis of Hydrazone-Modified Nucleotides and Their Polymerase Incorporation onto DNA for Redox Labeling Příprava DNA s modifikovanými bázemi enzymatickou inkorporací modifikovaných nukleosid-trifosfátů
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2009/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2010/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2011/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2012/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2012/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2013/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2013/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2014/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040901/2014/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software