Cílem navrhovaného projektu je analýza genetických faktorů podílejících se na regulaci pro-/antioxidační rovnováhy v patogenezi alergických respiračních nemocí. Pomocí technologie microarrays hodláme v buněčném materiálu z bronchoalveolárních laváží astmatiků a kontrolních jedinců identifikovat tzv. %22geny oxidačního stresu%22, které se podílejí na spuštění a udržování zánětu v dýchacích cestách. Geny, jejichž exprese se budou významně lišit mezi pacienty a kontrolami, budeme považovat za kandidátní a budeme u nich de novo analyzovat genetickou variabilitu. Budeme analyzovat vztah mezi klinickým fenotypem a substitucemi v přepisovaných i regulačních oblastech jak známých %22funkčních%22 kandidátních genů, tak i genů nově zjištěných na základě rozdílné exprese. Analýza genet. variant bude prováděna metodami založenými na PCR v asociačních studiích tzv. %22případů-kontrol%22 a dále potvrzena studiemi tzv. %22příbuzenských trojic%22 zahrnujícími potomky a jejich rodiče. U variant asociovaných s klinickým
Proposed project aims at analysing genetic factors participating in the regulation of the pro-/antioxidative balance in the pathogenesis of¨allergic respiratory diseases. In bronchoalveolar cells from asthmatic patients and control subjects, microarray technology will be used to identify oxidative stress-related genes involved in the initiation and progression of airway inflammation. Those genes exhibiting significantly different expression between affected and healthy subjects will be considered candidate genes and their genetic variability will be studied de novo. Further, association of polymorphism in transcribed and regulatory areas of a set of functional plus expression-related candidate genes with disease phenotype will be analysed by means of PCR-based methodology in a case-control study comprising unrelated subjects and subsequently confirmed in a study using %22family trios%22 approach. Finally, effects of associated variants on respective intermediate phenotypes (e.g. mRNA expression (en)
Many studies have proved the effect of individual genetically modified predisposition on the development of respiration diseases (esp. asthma and rhinitis) Due to the assumed role of oxidative stress in the pathogenesis of these states, the genes of enzy (en)
Řada již publikovaných prací prokázala, že se při rozvoji respiračních nemocí (zejména astmatu a rinitidy) uplatňuje individuální geneticky modifikovaná predispozice. Vzhledem k předpokládané úloze oxidačního stresu v patogenezi těchto stavů patří mezi z (cs)