About: Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB500960802
Description	Repetitive sequences make up a large proportion of most eukaryotic genomes. While they have traditionally been considered genomic parasites or junk DNA, recent data showed that at least some families of repetitive sequences play significant roles in a number of biological processes, some of which are cognate to their transcription. The major objective of this project is to carry out a comprehensive analysis of transcription of various repetitive sequences in a broad spectrum of plant species. Relevant data will be acquired using bioinformatics approaches combined with molecular and cytogenetic techniques. Transcriptionally active repeats will be characterized in term of the transcripts origin and structure as well as posttranscriptional processing and ultimate destiny. The obtained data will be important for deciphering potential biological roles of repetitive sequences and for our understanding of their interaction with host genomes. (en) Repetitivní sekvence tvoří velkou část genomů většiny eukaryot. Ačkoli byly dlouhou dobu považovány pouze za genomické parazity či nepotřebnou DNA, nedávné výsledky ukázaly, že některé repetitivní sekvence hrají významnou roli v řadě biologických procesů, z nichž některé jsou závislé na jejich transkripci. Hlavním cílem tohoto projektu je detailní analýza transkripční aktivity různých rodin repetitivních sekvencí u širšího spektra rostlinných druhů. Příslušná data budou získána použitím bioinformatických přístupů kombinovaných s molekulárními a cytogenetickými technikami. Transkripty repetitivních sekvencí budou analyzovány s důrazem nejen na jejich původ a strukturu, ale také na jejich posttranskripční úpravy a konečný osud. Výsledky získané během tohoto projektu budou důležité k rozluštění potenciální biologické funkce repetitivních sekvencí a k lepšímu porozumění jejich interakce s hostitelskými genomy.
Title	Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants (en) Původ, struktura a osud transkriptů repetitivních sekvencí u rostlin
skos:notation	KJB500960802
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB500960802/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB500960802/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-06-14 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82503011
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Repetitive sequences; transcription; siRNA; smRNA; RNAi; RNA interference; chromatin (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-03-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB500960802
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02008-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EA - Morfologické obory a cytologie ED - Fyziologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Při řešení projektu bylo prokázáno, že 1) všechny testované repetitivní sekvence jsou transkribované, ačkoli četnosti transkriptů jednotlivých typů repetic se liší a 2) že tyto transkripty jsou působením RNAi degradovány na siRNA. (cs) In the course of this project it has been demonstrated that 1) all tested types of repetitive sequences are transcribed, although abundances of their transcripts differ and 2) that the transcripts are processed by RNAi into siRNA. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Repetitive sequences RNA interference RNAi siRNA transcription smRNA
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500960802/2008/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500960802/2009/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500960802/2010/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500960802/2011/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software