About: Production of ergot alkaloid during the interaction of rye plant (Secale cereale) with fungus Claviceps purpurea

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Production of ergot alkaloid during the interaction of rye plant (Secale cereale) with fungus Claviceps purpurea Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP501/12/0597
Description	The fungus Claviceps purpurea is a naturally occurred parasite of rye. Infection of flowers initiates fungal sexual life cycle and synthesis of ergot alkaloids. Ergot alkaloids are used for preparation of various kind of therapeutics. Their biosynthetic pathway is encoded by the cluster containing 14 ORFs. The main objective of the project consists on preparation of fungus transgenic strains in order to enhance or change spectra of produced alkaloids by overexpression of selected cluster or regulation genes. Different strains of fungus and species of genus Claviceps varying in productivity will be screened for genetic variability to establish a link to ergot quality and quantity. Progression of plant infection is a crucial factor arbitrating quantity of produced alkaloids. Thus, the other aim of the project is expression profiling of genes involved in alkaloid biosynthesis and its regulation in order to map variation among different strains of C. purpurea. Subtractive hybridization will be used to reveal possible plant proteins important for susceptibility of rye to fungal pathogen. (en) Houba Claviceps purpurea je přirozeným parazitem žita, kdy infekce sporami neopýlených květu zahajuje sexuální cyklus houby během kterého dochází k produkci námelových alkaloidů. Námel slouží jako výchozí surovina k výrobě řady léčiv. Enzymy biosyntetické dráhy námelových alkaloidů jsou kódovány čtrnácti geny speciálního klastru. V rámci projektu budou připraveny transgenní kmeny nadexprimující vybrané geny klastru za účelem kvalitativní či kvantitativní změny složení námelových alkaloidů. Bude studovaná sekvenční variabilita a počty kopií jednotlivých genů u různých druhů rodu Claviceps lišících se ve spektru a kvantitě produkovaných alkaloidů. Zahájení a progrese infekce rostliny patogenem jsou klíčové pro výsledné množství produkovaných alkaloidů, proto budou sledovány změny v expresních profilech genů zapojených do biosyntézy alkaloidů a její regulace především u kmenů s různou produktivitou a transgenních kmenů. Metoda subtraktivní hybridizace bude využita pro hledání potencionálních genů v transkriptomu žita důležitých pro susceptibilitu rostlinného hostitele k patogenu.
Title	Production of ergot alkaloid during the interaction of rye plant (Secale cereale) with fungus Claviceps purpurea (en) Produkce ergoidních alkaloidů během interakce rostliny žita (Secale cereale) s parazitickou houbou Claviceps purpurea
skos:notation	GAP501/12/0597
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP501%2F12%2F0597/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP501%2F12%2F0597/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100778303
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EI - Biotechnologie a bionika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	ergot alkaloids Claviceps purpurea rye overproduction pathogenesis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P501-12-0597
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F12%2F0597/2012/orjk%3A15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F12%2F0597/2013/orjk%3A15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F12%2F0597/2014/orjk%3A15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F12%2F0597/2015/orjk%3A15310

Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software