About: Linking biogeochemisty of methane and molecular detection of methanogens and methanotrophs in river sediments.     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Results of our long-term study at the Sitka stream showed that methane production in the sediments and its gaseous emissions into the atmosphere are relatively important and inconsiderable from the point of view of local greenhouse gases sources. Since little or no data exist concerning methane production/consumption in running waters, the main aim of the project is to study spatial distribution of both methanogens and methanotrophs within river sediments and elucidate the differences in methane pathways and methane production/consumption durirng a year at different sites along the longitudinal profile of the small lowland stream Sitka. Samples of the hyporheic sediment will be collected using a freeze-core method and bacterial community and methanogenic potential will be determined. Detection of bacteria will be carried out by fluorescence in situ hybridization (FISH) ) targeting specific 16S rRNA sequences and by PCR, DGGE and T-RFLP targeting genes encoding specific enzymes. Stable isotope analysis of 13C/12C in methane gas samples will provide information on  the mechanisms and pathways of CH4 cycling. (en)
  • Naše dosavadní výzkumy na toku Sitka prokázaly, že produkce metanu v sedimentech a jeho plynné emise do ovzduší jsou poměrně významné a nezanedbatelné z hlediska lokálních zdrojů skleníkových plynů. Protože o produkci metanu v tekoucích vodách existuje doposud minimum informací, o jeho spotřebě metanotrofními baktériemi pak prakticky nevíme vůbec nic, je hlavním cílem našeho projektu studium prostorové distribuce metanogenních a metanotrofních bakterií v hyporheických sedimentech a objasnění rozdílů ve zdrojích substrátů pro metanogenezi a produkci/spotřebě metanu během roku na různých lokalitách podél malého nížinného toku Sitka. Vzorky dnového sedimentu za účelem determinace bakteriálního společenstva a stanovení metanogenního potenciálu budou odebírány pomocí freeze-core metody. Detekce bakterií bude prováděna pomocí metody FISH (fluorescenční hybridizace in situ), cílené na specifické 16S rRNA sekvence a PCR, DGGE a T-RFLP, zaměřené na detekci genů kódujících specifické enzymy. Analýza stabilních izotopů 13C/12C v plynných vzorcích metanu by měla poskytnout informaci o mechanismech vzniku a koloběhu CH4.
Title
  • Linking biogeochemisty of methane and molecular detection of methanogens and methanotrophs in river sediments. (en)
  • Biogeochemie metanu a detekce metanogenních a metanotrofních bakterií v říčních sedimentech
skos:notation
  • GA526/09/1639
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • river; sediments; methane; methanotrophy; greenhouse; gases; stable; isotopes (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Výsledky projektu ukazují, že i v malých tocích existují rozsáhlá společenstva metanogenních bakterií, které ovlivňují difúzi a toky metanu ze sedimentů do vody. Hlavní výsledky jsou v závěrečné kartě projektu jasně popsány. Hlavními výstupy je jedna publikace v časopise s IF a kapitola v knize, další manuskripty jsou odeslány. Čerpání prostředků proběhlo dle pravidel GAČR, bez připomínek. (cs)
  • The results of the project indicate that large communities of methanogenic Archae occur even in small streams and affect the diffusion/fluxes of methane from sediments to water. Main results are well described in the final project report. To date, main outputs are one paper in a SCI journal and one book chapter, other manuscripts are under review. Financial management is without any objections. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • river
  • gases
  • greenhouse
  • methane
  • methanotrophy
  • sediments
  • stable
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data]
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software