About: Immune response genes in the horse     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Projekt je příspěvkem k celosvětovému programu mapování genomu koně. Zaměřuje se na studium polymorfismu genů, které hrají úlohu v genetické determinaci imunitní odpovídavosti koně. U každého genu budou určeny primery vymezující jednu nebo více jeho oblastí (promotorů, exonů intronů, 3´UTR) se zaměřením na místa předpokládaného polymorfismu, bude optimalizován PCR protokol, amplifikované produkty budou subklonovány a jednotlivé klony sekvenovány. Na základě znalosti sekvencí bude učiněn pokus o vypracování typizační metody, např. RFLP nebo SSCP. Analyzovány budou tři kategorie těchto genů. U genů, jejichž sekvence není u koní známa (Nramp 1, iNOS) budou primery určeny na základě homologie s jinými, zejména příbuznými druhy. U genů, jejichž sekvence je u koní známa, ale kde dosud nebyl popsán polymorfismus (TNF-alfa), budou určeny specifické primery. Z genů, jejichž polymorfismus byl u koní popsán, se pozornost soustředí na gen ELA-DQB, u nějž byly specifické primery pro druhý exon designov (cs)
  • Genes known to be involved in immune responses in other species will be studied in the horse. Primers specific for different parts of such genes (exons, introns, promoters, 3´UTR) will be designed in order to amplify potentially polymorphic sites. PCR protocols will be set-up for each pair of primers, and the corresponding region will be amplified, sub-cloned into an appropriate vector and the clones will be sequenced. Based on the sequences determined, an attempt to set-up a typing method (e.g. RFLPor SSCP) will be done. Three types of genes are supposed to be analysed. for genes, whose sequence are unknown, and whose existence in the horse is assumed, like Nramp1 and iNOS, the primers are expected to be designed based on homologous sequences from other, especially closely related species. Genes whose sequences have been determined in the horse without reporting on their polymorphism, like TNF-alpha, will be amplified by using horse-specific primers designed from the GenBank sequence. Out of genes (en)
Title
  • Immune response genes in the horse (en)
  • Studium některých genů imunitní odpovídavosti koně (cs)
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • Neuvedeno. (en)
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data]
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software