About: Triplex-forming DNA and its interactions with p53 proteins     Goto   Sponge   Distinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz:8890 associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Structure-selective DNA recognition is an important characteristic of not only tumor suppressor protein p53 (wtp53), but also of its oncogenic mutant forms (mutp53). It is supposed that, besides its sequence, DNA conformation is crucial for p53-DNA interactions in cells. This project is aimed to investigation of interactions of both wtp53 and mutp53 with DNA containing sequences that adopt intramolecular triplex structures in superhelical DNA (scDNA). Interaction of p53 with DNA involving the triplex structures will be compared with earlier described p53 binding to DNA forming other local structures (e.g. DNA cruciforms). Several biochemical and molecular biological approaches will be applied. Particular attention will be aimed to the methodsdetection of DNA-protein interaction and for probing triplex DNA structures in vitro and in vivo. Development and optimization of a new technique for studying p53 interactions with scDNAs, based on immobilization of the intramolecular triplex-containing (en)
  • Strukturně selektivní interakce s DNA je důležitou charakteristikou nejenom nádorového supresorového proteinu p53 (wtp53), ale i jeho onkogenních mutantních forem (mutp53). Předpokládá se, že při  interakci p53 s DNA v buňce je kromě sekvence nukleotidů důležitá také konformace rozpoznávaného elementu DNA. Tento projekt je zaměřen na studii interakcí jak wtp53, tak vybraných mutp53 s DNA obsahující sekvence, které vytvářejí intramolekulární triplexové struktury v nadšroubovicové DNA (scDNA). Interakce proteinů p53 s  DNA obsahující triplexové struktury budou srovnány s již dříve popsanou vazbou p53 na DNA vytvářející jiné lokální struktury (např. křížovou formu). Při řešení této problematiky bude využito několik biochemických a molekulárně biologických přístupů. Důraz bude kladen zejména na metody studia interakce DNA-protein a detekce triplexových struktur DNA in vitro a in vivo. Součástí projektu je vývoj a optimalizace nové techniky pro studium vazby p53 na scDNA založené na imobilizaci (cs)
Title
  • Triplex-forming DNA and its interactions with p53 proteins (en)
  • DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53 (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • tumor suppressor p53; oncogene; DNA-protein interaction; immunoprecipitation; triplex (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data]
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 14 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software